Lo primero que haré será definir lo que significa cada término.
GPT, Table de Partición GUID, es un estándar para la colocación de la tabla de particiones en un disco duro físico. Es parte del estándar Extensible Firmware Interface (EFI) propuesto por Intel para reemplazarla desfasada BIOS del PC, una de las pocas réplicas que quedan, heredada del IBM PC original.
MBR, Master Boot Record, es el primer sector («sector cero») de un dispositivo de almacenamiento de datos, como un disco duro. A veces, se utiliza para el arranque del sistema operativo con bootstrap, otras veces es usado para almacenar una tabla de particiones y, en ocasiones, se usa sólo para identificar un dispositivo de disco individual, aunque en algunas máquinas esto último no se usa y se ignora.